陰陽神簽源於中國道教文化，其核心哲學理念融合了陰陽五行學說。陰陽學說認為宇宙萬物由相互對立的陰陽二氣構成，五行學說則通過金、木、水、火、土五種元素的相生相剋解釋自然規律。這種世界觀深刻影響了陰陽神簽的占卜體系，使其成為一種結合天文、曆法與人文的占卜工具。靈簽內容往往蘊含陰陽平衡、五行調和的哲理，如「龍蟠千江谷，虎踞萬山湖」的簽文，既描繪自然景象，又暗含陰陽相生之意。
陰陽神簽的起源可追溯至先秦時期的占卜傳統，如《左傳》中記載的「枚卜」和《楚辭》中的「筵」占卜法。這些方法通過竹塊或草莖的投擲判斷吉凶，與陰陽神簽的擲杯占卜形式一脈相承。唐宋時期，隨着道教與佛教的興盛，靈簽文化逐漸普及，籤詩內容開始融入儒釋道思想，成為民間信仰的重要組成部分。明清時期，陰陽神簽在福建、廣東等地廣泛流傳，並隨着華僑傳播至東南亞，成為華人社群中重要的精神寄託工具。